El primer museo público de México fue el Museo de Historia Natural que se inauguró en el centro de la capital en el año de 1970, a partir de su inauguración este recinto mostraba flora y fauna de Nueva España y una colección de objetos científicos de la época.

El museo es fue un conjunto de objetos provenientes de la naturaleza en el siglo XVI que eran producto de las constantes expediciones marítimas comenzando la investigación científica y biológica de América.

La mayoría de los objetos recolectados fueron producto de las expediciones encargadas por el Rey Carlos III que envió una expedición a Nueva España con el objetivo de estudiar sus animales, plantas y minerales a cargo José Longinos Martínez.

Como resultado en 1970, Longinos se instaló en lo que aquel entonces era Plateros, actualmente Madero número 89 creando lo que en aquel entonces se conoció como el “Primer Gabinete de Historia Natural”.

Estas instalaciones se vieron enriquecidas ya que además de la colección de Longinos contó con donaciones de personajes como: Fausto Fermín Delhuyar, pero dicho espacio fue desintegrado a causa de la Guerra de Independencia.

La lucha de 1810 provocó saqueos por lo que gran parte de la colección se ve perdida, pero los objetos que pudieron verse salvados fueron colocados posteriormente en el Colegio San Idelfonso.

Posteriormente la sede incremento su acervo y se instaló como sede de la Sociedad Mexicana de Historia Natural. Fue a inicios del siglo XX que se inauguró el espacio en la segunda sección del bosque de Chapultepec.